国科金发计〔2024〕125号新西瓜影院
国度当然科学基金委员会现发布免疫力数字解码紧要商酌筹划2024年度名目指南,请肯求东说念主及依托单元按名目指南所述的要乞降拖拉事项肯求。
国度当然科学基金委员会
2024年4月12日
免疫力数字解码紧要商酌筹划2024年度名目指南
免疫力是东说念主体抗击病原入侵,废除抗原性异物,监控及维系机体健康稳态的详尽智商。免疫系统普遍万般性和复杂性是免疫力的关键基础,而传统商酌模式未能系统揭示免疫力生成和演变规矩。本紧要商酌筹划荧惑科常识题驱动与数据驱动相联接的科研范式变革,资助可产生质地高、扩张性强、集成性好的免疫力数据的名目,竖立合股的数据汇交不休机制和平台,范例化获取东说念主体免疫力大数据。通过免疫力大数据的数字呈现与深度解码,全景式领路健康及疾病情景下东说念主体免疫系统的源流机制,多角度阐述免疫力的科学内涵,促进精确诊疗,做事于“健康中国”计谋。
一、科学观点
基于高质地、范例化的免疫力大数据,开展东说念主体免疫力合座性和系统性数字化领会与重构商酌,揭示免疫力组成的生物基础、免疫力保管的关键特征和免疫力调控的普适规矩,进而阐述免疫力的科学内涵;对免疫力进行定量化表征和数字化呈现,竖立东说念主群免疫力特征图谱,分析免疫力与软弱、疾病等紧要人命健康事件的关系并阐释其内在机制和规矩;斥地基于免疫力数据的疾病风险预警、免疫力可视化和免疫力年事测定等关键时候,竖立个体和群体的免疫力档案,开展基于免疫力扰乱的健康爱戴及疾病防治新策略,造成未病先防、疾病早诊、预后评估、个性化医疗和健康不休新模式。
二、中枢科常识题
(一)免疫力复杂系统的物资基础和动态规矩。
针对免疫力复杂系统的高度万般性、时空动态性、多维交互性、自主合适性和模式缅思性等特色,继承动态化、跨模范、多档次的全景商酌新范式,以模子驱动和数据驱动相联接的商酌方法,明确免疫力复杂系统的时空动态特征,阐述免疫力的组成要素、内在筹谋与变化规矩等生物学内涵,揭示免疫力骨子规矩和深层源流机制。
(二)多模态免疫力定量表征及数字呈现。
竖立不同免疫力表征状态的东说念主群部队,获取并分析免疫分子和细胞的万般性信息,系统领会在分子、细胞、细胞间关联、器官、东说念主群等不同模范的免疫力数据,造成范例化的多维免疫大数据群,对多源、高维、跨模范的免疫力数据进行耦合、重构与全景化表征,罢了免疫力数字化呈现和量化评估,精确形容免疫力肖像。
(三)基于免疫力解码的疾病诊疗与健康评估。
阐述紧要人命健康事件的免疫力特征过甚演变规矩,获取紧要疾病在器质性病变前的免疫力信号,栽培基于免疫力解码的疾病分子分型、精确诊疗与预后评估范例,并整合传统医学证候辨识和“治未病”等理念与方法,构建疾病预警系统,实时评估健康状态并发现疾病早期隐患,为关键人命历程的免疫力扰乱提供表面依据。
三、2024年度资助商酌标的
本紧要商酌筹划拟聚焦我国高发病/高示寂率恶性肿瘤、本人免疫性疾病等紧要疾病,优先资助本筹划尚未立项的疾病类型,针对不同免疫状态,以获取高质地、多维度、时空动态的东说念主体免疫力大数据为前提,荧惑依托具有完善基础数据和随访决策的部队资源,竖立关键时候群,旨在阐述免疫复杂系统动态协同模式和时空交互规矩。本筹划拟树立培育名目、要点支捏名目及集成名目:
(一)培育名目。
围绕上述科常识题,以总体科学观点为牵引,立足商酌范式革命,对于探索性强、选题新颖、前期商酌基础较好的肯求名目,将以培育名目的花式赐与资助,具体商酌标的如下:
1. 健康状态免疫力特征与变化规矩。
围绕不同庚事阶段(如婴幼儿、芳华期、成年、老年等),不同健康状态(如长命、中医偏颇体质等),不同遗传布景或特殊生涯环境的东说念主群,荧惑继承高通量多组学时候,采集生理状态下免疫细胞发育与新式细胞亚群、免疫识别与活化、免疫缅思与耗竭、免疫代谢与表不雅遗传等免疫力数据,丰富免疫系统可测量参数,延展免疫力大数据的掩盖维度,解码免疫行径并揭示深层规矩,竖立健康个体的免疫力档案。从免疫力维度表征机体的健康状态,罢了东说念主体免疫年事及健康状态的数字判读。
2. 紧要疾病状态免疫力动态感知机制。
针对我国高发病/高示寂率恶性肿瘤和本人免疫病等紧要疾病,从分子、细胞、组织、器官、证候等不同模范,分析疾病发生发展等关键枢纽的免疫特征信息,如免疫微环境、免疫调换与耐受、移植免疫抛弃、免疫细胞过甚亚群、肿瘤新抗原等,揭示免疫力时空变化与疾病演进历程之间的关联性和因果性,竖立微不雅免疫力数值与宏不雅疾病表征之间的定量映射关系,阐述免疫力在紧要疾病时空演变历程中的动态规矩和机制。
3. 东说念主工智能赋能的免疫力量化表征及数字化呈现。
竖立从免疫细胞群和免疫分子等免疫载体数据中拿获用于量化免疫特征信息的新方法,发展诸如可解释机器学习等先进东说念主工智能时候,对多源、高维、跨模范的免疫力数据进行耦合重构,斥地前沿缠绵模子和大数据领会算法,提真金不怕火不错表征免疫力的多维信息,罢了免疫力的数字化与全景化呈现。
4. 免疫复杂系统的时空动态特征。
针对代表性疾病或免疫历程,基于复杂系统的视角,商酌免疫力组成元件、关系集聚、系统结构等关键要素,会通收复论、为止论、系统论等方法,定量商酌免疫力的档次性、败露性、动态踏实性、自主合适性等复杂系统特色,商酌这些特色与免疫分子、细胞行径或证候表征等的映射关系,探究免疫复杂系统源流的主要特征、普适规矩及深层机制,定量探索免疫力的科学内涵和生物基础。
5. 基于免疫力数字解码的紧要疾病预警。
围绕肿瘤、本人免疫性疾病等紧要疾病的“未病”状态,比对病变前后及健康东说念主群的免疫力大数据,通过免疫检测新时候(如新组学时候、流式时候过甚他可视化时候等)和免疫数据智能化分析新方法,挖掘疾病演进的特异免疫应答模式,决然不错表征疾病演进的免疫力信号,构建免疫力维度的疾病预警模子并考证其明锐性和特异性,从免疫力视角发现紧要疾病的早期关键特征,罢了紧要疾病的早期精确会诊。
(二)要点支捏名目。
围绕中枢科常识题,以总体科学观点为牵引,立足商酌范式革命,对于前期商酌基础累积较好,荒谬是与本紧要商酌筹划其它肯求名目或者造成学科交叉、上风互补且共同对总体科学观点造成攻击孝顺的肯求名目,将以要点支捏名目的花式赐与资助,具体商酌标的如下:
1. 免疫力大数据的范例化获取与深度挖掘。
竖立不同免疫状态如健康群体、本人免疫病(如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎)、恶性肿瘤(如肺癌、肝癌、结肠癌、胰腺癌)的中国东说念主群大样本部队,获取并汇交疾病不同阶段(如发生、发展、调整前后等)的范例化数据,完善免疫力多维大数据采集的范例与范例,研发多模范免疫力数据会通与分析的新方法,发现疾病发生发展等历程中的免疫力特征。
2. 免疫组库等万般性特征的数字化呈现。
竖立TCR、BCR和MHC等免疫万般性大数据拿获新方法(如重轻链全长获取和功能性配平等),发展免疫组库大数据的编码规矩深度挖掘、疾病关键特征提真金不怕火、高维特征信息数据降维和万般性分子功能聚类等关键中枢时候,基于万般性免疫特征量化表征东说念主体免疫力水平,揭示免疫力万般性特征与疾病和健康的内在关联,形容群体和个体免疫力数字肖像和时空图谱,从免疫组库视角揭示东说念主体免疫力万般性的动态变化规矩。
3. 跨模范免疫力大数据耦合与群体免疫力特征领会。
系统整合多中心多着手的数据,开展多模范免疫力大数据耦合、分析等新方法援手临床样本部队分析的商酌,为多中心多着手的数据提供生信分析与考证等因循。基于耦合的多中心数据,商酌不同庚事、性别、体质和遗传布景的东说念主群免疫力万般性和相反性,创建东说念主群免疫力特征图谱,开展基于免疫力扰乱的健康爱戴及疾病防治新策略及新步伐商酌,罢了群体层面免疫力的健康监测与扰乱。
(三)集成名目。
竖立一种高致死性恶性肿瘤前瞻性多中心部队及健康对照部队,严格按照数据范例(详见附件1)采集并汇交肿瘤及外周血匹配的免疫力大数据,揭示明锐性高的肿瘤早期免疫力特征,竖立准确度高、泛化智商强的肿瘤早期会诊东说念主工智能模子并考证其遵守,探索模子可解释性,挖掘肿瘤发生、线路、调整反应与免疫力重塑的内在科学规矩与生物学基础。
具体要求如下:
1. 临床中心数量不少于5个;
2. 疾病部队东说念主数不少于1000例;
3. 健康对照部队东说念主数不少于300例;
4. 肿瘤及外周血匹配例数不少于300例;
5. 荧惑采集包括新援手调整等调整前后对照样本。
四、2024年度资助筹划
2024年度拟资助培育名目10- 15项,资助奏凯用度资助强度约为80万元/项,资助期限为3年,培育名目肯求书中商酌期限应填写“2025年1月1日- 2027年12月31日”;拟资助要点支捏名目4- 5项,资助奏凯用度资助强度约为300万元/项,资助期限为4年,要点支捏名目肯求书中商酌期限应填写“2025年1月1日- 2028年12月31日”;拟资助集成名目1项,资助奏凯用度资助强度约1300万元/项,资助期限为3年,集成名目肯求书中商酌期限应填写“2025年1月1日- 2027年12月31日”。
五、肯求要求及拖拉事项
(一)肯求要求。
本紧要商酌筹划名目肯求东说念主应当具备以下要求:
1. 具有承担基础商酌课题的经验;
2. 具有高档专科时候职务(职称)。
在站博士后商酌东说念主员、正在攻读商酌生学位以及无责任单元或者所在单元不是依托单元的东说念主员不得行为肯求东说念主进行肯求。
(二)限项肯求礼貌。
实践《2024年度国度当然科学基金名目指南》“肯求礼貌”中限项肯求礼貌的关联要求。
(三)肯求范例。
1. 肯求东说念主应证据本紧要商酌筹划拟惩办的中枢科常识题和名目指南公布的拟资助商酌标的,自行拟定名目称呼、科学观点、商酌内容、时候阶梯和奏凯用度等。
2. 本紧要商酌筹划名目实行无纸化肯求,肯求东说念主应当按照科学基金集会信息系统中紧要商酌筹划名目的填报说明与撰写提节录求在线填写和提交电子肯求书及附件材料。肯求书提交日历为2024年5月16日- 5月23日16时。
3. 肯求书中的资助类别遴荐“紧要商酌筹划”,亚类说明遴荐“培育名目”、“要点支捏名目”或“集成名目”,附注说明遴荐“免疫力数字解码”,受理代码遴荐T03,证据肯求的具体商酌内容遴荐不稀奇5个肯求代码。
培育名目和要点支捏名目的合营商酌单元不得稀奇2个。集成名目的合营商酌单元不得稀奇4个。
4. 肯求东说念主在“立项依据与商酌内容”部分,当先明确肯求对应本名目指南中的资助商酌标的,以及对惩办本紧要商酌筹划中枢科常识题、罢了本紧要商酌筹划科学观点的孝顺。
若是肯求东说念主也曾承担与本紧要商酌筹划关联的其他科技筹划名目,应当在肯求书正文的“商酌基础与责任要求”部分评释肯求名目与其他关联名目的区别与筹谋。
(四)肯求拖拉事项。
肯求东说念主和依托单元应当厚爱阅读并实践本名目指南、《2024年度国度当然科学基金名目指南》和《对于2024年度国度当然科学基金名目肯求与结题等关联事项的晓谕》中关联要求。
1. 依托单元应当按照要求完成依托单元承诺、组织肯求以及审核肯求材料等责任。在2024年5月23日16时前通过信息系统逐项阐发提交本单元电子肯求书及附件材料,并于5月24日16时前在线提交本单元名目肯求清单。
2. 为罢了紧要商酌筹划总体科学观点和多学科集成,赢得资助的名目负责东说念主应当承诺遵循关联数据和尊府不休与分享的礼貌(详见附件数据范例和数据安全不休要求),名目实践历程中应矜恤与本紧要商酌筹划其他名目之间的相互因循关系。
3. 为强化顶层想象,杰出本紧要商酌筹划革命商酌范式和不休模式,肯求东说念主须按照指南要求将数据采集和汇交(每半年)的观点、筹划和承诺行为附件上传,并附本东说念主署名和依托单元盖印,不然名目肯求将不予受理。参考模板可见本紧要商酌筹划数据平台https://ngdc.cncb.ac.cn/idp/。
4. 为加强名目的学术换取,促进名目群的造成和多学科交叉与集成,本紧要商酌筹划将每年举办一次资助名目的年度学术换取会,并将不依期地组织关联范畴的学术探究会。获资助名目负责东说念主须干预本紧要商酌筹划率领众人组和不休责任组所组织的上述学术换取行径。
(五)盘问花式。
国度当然科学基金委员会交叉科学部三处
筹谋电话:010-62327096
附件1
数据范例
通盘名目产生的数据须有完备的患者临床信息及匹配的高通量组学数据(数据类型见下文)。患者临床信息包括个体健康体检信息和疾病会诊、调整、预后等随访信息。名目负责东说念主必须依照指南要求范例提供数据。名目肯求书须态状样本数量及年度数据产生筹划,数据的样本数量与数据范例将被纳入评审和侦察范例。
一、样本采集要求
肿瘤样本须有肿瘤组织和血液样本。样本须有准确的临床病理信息,包括会诊、调整、预后等随访信息,须配备病理切片H&E染色效率。若有剩余样本,可冷冻保存以供后期实验考证。其他疾病如本人免疫病等疾病样本证据疾病特色和检测技能取样,具体要求可参考肿瘤样本。要求如下:
1. 样本采集范例
1.1 组织标本:组织标本应尽量去除坏死组织、血渍秽物等可能影响检测效率的因素,证据不同的商酌目的进行OCT包埋、福尔马林固定、液氮速冻、组织解离等初步处理,以上设施应在标本离体60分钟内完成。肿瘤标本应包括无坏死的肿瘤组织,其他类型组织标本如淋攀附须收用有代表性的病变组织区域,组织标本的质地须至少知足基础型数据的实验需求;
1.2 外周血样本:按照不同的实验要求采集相应量的外周静脉血标本,采集量须知足基础型数据实验需求。依据实验需要对样本进行分辨、冻存等处理,血浆或血清的提真金不怕火须在30分钟内完成,-80℃保存。其他相应操作如免疫细胞分选等应在采样后12小时内完成。
2. 样本的质地为止
2.1 肿瘤组织:肿瘤组织质地不低于0.5克,肿瘤样品纯度不低于60%,肿瘤组织坏死率小于20%。肿瘤组织须有病理切片以准确判断肿瘤组织类型和组织学特征。其他组织要求参考肿瘤组织的质地为止范例;
2.2 血液样本:无凝血和溶血等情况,如进行免疫细胞分选,每例分辨出的PBMC数量应大于8×106,T细胞数量大于3×106,B细胞数量大于1×106,细胞存活率大于95%。
聚色庄园3. 样本的运输:使用专用保存液、干冰或者液氮进行组织样本及外周血标本的运输。
4. 样品的保存:冻存于-80℃雪柜或者液氮中,须分装保存,幸免反复冻融。
5. 样本必须提供详备的临床病理信息,具体要求如下:
5.1样本采集对象的可追思独一ID(如入院号等);
5.2 样本采集对象的病理类型、病理分期(如TNM分期)、病理切片编号、会诊时辰、实验室搜检效率、影像学答复等;
5.3 样本采集时辰、处所、采集花式(活检/手术切除等)、样本运输保存花式(冷冻组织、冰冻切片、石蜡切片等)、样本量(克、毫升)、样本纯度、组织坏死率;
5.4组织样本及血液样本所作检测称呼、检测时候旅途、检测数据答复。
二、临床信息数据类型
可追思独一识别ID、性别、年事、民族、地区、血型、身高、体重、过敏史、恶性肿瘤家眷史、免疫疾病家眷史、感染史、抽烟史、饮酒史等;实验室搜检(样本采集时)、影像学搜检、病理搜检答复、调整情况和预后情况等,荒谬是随访信息和调整反应情况。
三、高通量组学数据类型
1. 外周血
TCR-Seq、BCR-Seq、单细胞多组学检测时候(scRNA-seq、scATAC-seq、scTCR-seq、scBCR-seq),荧惑获取TCRαβ链配对数据、BCR轻重链配对数据、以及对应抗原的匹配数据,荧惑通过CyTOF等方法赢得淋巴细胞淡雅分群数据。
2. 组织样本
TCR-Seq、BCR-Seq、WES(包括组织样本和对应个体外周血)、RNA-Seq、单细胞多组学检测时候(scRNA-seq、scATAC-seq、scTCR-seq、scBCR-seq),荧惑获取TCRαβ链配对数据、BCR轻重链配对数据、以及对应抗原的匹配数据,荧惑通过CyTOF等方法赢得淋巴细胞淡雅分群数据。
四、数据质控范例
1. bulk TCR/BCR测序数据范例:外周血单样本clonotypes平均值不低于100,000种,组织样本clonotypes平均值不低于10,000种,重链和轻链各不少于1,000,000读数,单样本测序量不低于2Gbp (其中有用clonotype的界说为:或者拼装出全长氨基酸序列且不包含拆开密码子,具有明确的胚系V和J基因信息,同期CDR3区域含有典型的保守序列)。
2. bulk RNA-Seq测序范例:DV200不低于50%,检测掩盖不低于50M reads。
3. WES测序范例:单碱基掩盖率不低于100X,检测盒掩盖不低于32MB。
4. 单细胞检测时候目的:
4.1 scRNA-seq:测序目的(有用barcodes不低于75%,有用UMIs不低于75%,RNA read Q30不低于75%);细胞目的(单个样本细胞数不少于5000个,平均每个细胞的测序read pairs数大于20000,单个细胞基因中位数大于1000);
4.2 scTCR-seq/scBCR-seq:平均每个细胞所测得的VDJ文库read pairs数不低于5000,RNA read Q30 不低于75%,有用barcodes不低于75%;细胞目的(3000-80000个细胞/芯片);
4.3 scATAC-seq: 测序目的(测序read pairs不小于25000,有用barcodes不低于75% ,barcode Q30大于65%,read1/2 Q30大于65%,样本指数的Q30大于90%);细胞目的(单个样本细胞数不少于5000个,高质地测序片断大于40%)。
五、其他要求
1. 肯求东说念主须严格遵循《中华东说念主民共和国生物安全法》《中华东说念主民共和国东说念主类遗传资源不休条例》等关联礼貌,并严格遵循医学伦理和患者知情首肯等范例要求。触及东说念主类遗传资源商酌的名目肯求书中应提供所在单元或上司垄断单元伦理委员会的审核诠释(电子肯求书应附扫描件),不然将不予受理。
2. 获资助的名目须按要求进行关联科学数据采集,并将原始数据每半年上传至本筹划指定的数据平台(https://ngdc.cncb.ac.cn/idp/)。
附件2
数据安全
为加强和范例科学数据不休,凡获资助的名目负责东说念主须承诺罢黜如下数据安全不休要求,明确包袱主体,保险科学数据的合股汇交、灵通分享及安全垄断。
一、包袱主体和职责
1.名目负责东说念主是数据汇交的包袱主体,任何垄断我国东说念主类遗传资源开展科学商酌(含外洋合营商酌)的名目,须遵循《中华东说念主民共和国东说念主类遗传资源不休条例》等国度法律律例和关联要求1,包括但不限于上述不休条例、医学伦理、患者知情首肯等。
2.本紧要商酌筹划栽培的率领众人组(以下简称众人组),负责其资助名目所产生数据的统筹不休,总体息争各名目的数据范例不休和分享共用,股东罢了本紧要商酌筹划的总体观点。
3.本紧要商酌筹划指定的免疫力数据不休平台(以下简称数据不休平台),行为科学数据不休方负责数据的存储存档和安全不休,在众人组率领和息争下,依期公布本紧要商酌筹划所产生的数据,推动本紧要商酌筹划的数据合股汇交不休和安全分享垄断。
二、数据汇交
1. 凡产生数据的资助名目,名目负责东说念主须明确拟产出数据的类型、数据量、汇交时辰、探听权限等,且须按照年度责任筹划向数据不休平台汇交数据,所少见据的汇交不晚于名目结题时辰,数据分享探听权限由名目负责东说念主设定。
2. 名目负责东说念主须提供样本采集信息、个体临床信息及匹配的高通量组学数据等,准确且详备的态状关联元数据,完成基础型数据过甚他拓展性数据的原始数据和元数据(包括采样和临床)汇交。汇交数据的质地和体量是年度侦察的攻击依据。
3. 汇交分享数据如触及东说念主类遗传资源数据,名目负责东说念主在提交数据前,搪塞个东说念主信息采选去标志化处理,以确保秘籍保护和安全垄断。在数据提交时,应明确说明数据观点使用者(即仅限国内用户或国表里用户均可)及数据使用范围等关联信息。
三、数据分享
1. 数据分享罢黜“灵通为常态,不灵通为例外”原则,数据不休平台为本紧要商酌筹划各名目提供数据合股汇交和安全分享做事。
2. 数据在灵通分享前,名目负责东说念主应罢黜《东说念主类遗传资源不休条例实施确定》的关联礼貌,完成东说念主类遗传资源信息的备案备份和事前答复。
3. 本紧要商酌筹划的数据不休平台提供两种分享花式:公开探听和受控探听。公开探听,即无需探听权限或肯求范例,用户可解放获取和使用已公斥地布的数据及对应的元数据信息;受控探听,即继承“肯求-审核”制获取数据探听权限,数据使用者在数据不休平台向数据对应的名目负责东说念主提倡使用肯求,名目负责东说念主审核肯求并反馈审核意见。
4. 为加强本紧要商酌筹划各名目之间的数据分享垄断过甚相互因循,肯求使用数据的名目负责东说念主须在数据不休平台中提倡数据使用肯求并明确数据用途,数据汇交的名目负责东说念主对肯求进行审核。众人组统筹息争各方在数据分享、整合垄断、专利论文发表等方面的权责、义务等事项。
12018年4月国务院办公厅印发的《科学数据不休办法》;2019年7月1日起实施的《中华东说念主民共和国东说念主类遗传资源不休条例》;2023年7月1日起实施的《东说念主类遗传资源不休条例实施确定》;2021年4月15日推行的《中华东说念主民共和国生物安全法》;2021年9月1日实施的《中华东说念主民共和国数据安全法》;2021年11月1日起实施的《中华东说念主民共和国个东说念主信息保护法》新西瓜影院。